В истории церковь упоминается в связи с событиями Отечественной войны 1812 года. В своих «Записках…» могилевский игумен Орест отметил: «В селе Вейне, французы, отбивши церковные двери, квартировали в церкви и посреди церкви кушанье себе варили…». Упоминание о Вейнянской «круглой» церкви есть и в документах, хранящихся в Российском Государственном историческом архиве Санкт-Петербурга.
Церковь действовала вплоть до 1920-х годов, после чего продолжительное время была закрыта. Возобновлена ее работа была в период оккупации, продолжилась и в послевоенный период. В советские времена сюда приезжали венчаться и крестить детей те, кто не хотел огласки в Могилеве.
В наши дни церковь продолжает действовать, обновляется иконами и новыми росписями, а на территории храма бьет источник, вода которого считается целебной.