Участник боёв в Беларуси против немецко-фашистских захватчиков в годы Великой Отечественной войны.
Родился в д. Калмыки Болаховского района Тульской области. Член КПСС с 1939 г. Участник 1-й мировой войны. С 1918 г. в Красной Армии, участник Гражданской войны.
Окончил Военную академию РККА им. М.В. Фрунзе (1939). Участник советско-финляндской войны 1939–40 гг., командир стрелкового полка.
С первых дней Отечественной войны на фронте. Участвовал в обороне Могилёва, у деревень Буйничи, Бутримовка, Барсуки. Сконцентрировав крупные силы артиллерии и танков, немецкое командование намеревалось прорвать на этом участке оборону советских войск и захватить Могилёв. Советские войска мужественно вели бой, за 2 дня боёв подбили и сожгли 39 танков, 3 самолёта. Бои за город продолжались до 26 июля, в которых полковник С.Ф. Кутепов проявил большие организаторские способности. Погиб в бою.
Писатель К. Симонов, который во время боёв находился на позиции этого полка, в своих военных дневниках отмечал: "Недолгая встреча с Кутеповым для меня была одной из самых значительных за годы войны. В моей памяти Кутепов – человек, который, останься он жив там, под Могилёвом, был бы способен на очень многое".
Награждён орденом Красного Знамени.
Именем С.Ф. Кутепова названа улица в Могилёве; в честь защитников Могилёва на Буйничском поле установлен обелиск.