Герой Советского Союза (24.07.1936). Советский лётчик, генерал-полковник авиации (1961), участник освобождения Беларуси от немецко-фашистских захватчиков в годы Великой Отечественной войны.
Родился на разъезде Тарышта Омской железной дороги. Член КПСС с 1936 г. Трудовую деятельность начал рабочим. В 1926 г. добровольцем вступил в Красную Армию. Окончил Первую военную школу лётчиков имени А. Ф. Мясникова (1928), Высшую военную академию имени К. Е. Ворошилова (1951, сейчас Военная академия Генерального штаба Вооружённых сил Российской Федерации), учился в академии им. Н. Е. Жуковского (1934–35). С 1931 г. лётчик-испытатель (инструктором стал В. П. Чкалов).
В 1936 г. совместно с В.П. Чкаловым и А.В. Беляковым совершил беспосадочный перелёт из Москвы через Северный Ледовитый океан, Петропавловск-Камчатский на остров Удд (ныне остров Чкалов); за этот подвиг удостоен звания Героя Советского Союза. Депутат Верховного Совета СССР 1-го созыва (1937—1946 гг.).
В 1937 г. в составе того же экипажа впервые в истории перелетел без посадки из Москвы через Северный полюс в г. Ванкувер (США). Преодолев 12 тыс. км. и установив мировой рекорд дальности полёта без посадки, советские лётчики продемонстрировали триумф советской авиации.
Незадолго до начала Великой Отечественной войны был принят в Союз писателей СССР. Автор документальной литературы.
Участник советско-финляндской войны 1939–40: командовал авиагруппой и авиаполком.
Во время Отечественной войны с ноября 1941 г. командовал авиационными дивизией и корпусом, военно-воздушными силами 4-й ударной армии.
С 1947 г. начальник Главного управления Гражданской авиации, с 1951 г. на руководящей работе в Министерстве обороны СССР. Депутат Верховного Совета СССР в 1937–46 гг.
С сентября 1972 — научный консультант главнокомандующего Войсками ПВО страны. C мая 1988 генерал-полковник авиации Г. Ф. Байдуков — в отставке.
Жил в Москве. Г. Ф. Байдуков — кавалер наибольшего количества орденов СССР (21 орден).
Умер 28 декабря 1994 г. Похоронен в Москве, на Новодевичьем кладбище.
Именем Г.Ф. Байдукова названа улица в Могилёве.