Родился 18 июля 1809 г. в г. Черикове Могилевской губернии (сейчас Могилевская область) в семье служащего. Брат Степан Семенович Куторга (24.02.1805–07.05.1861, ученый-естествовед, педагог).
Обучался в Могилевской мужской гимназии, в 3-й Петербургской гимназии.
1827 г. – поступил в Императорский Санкт-Петербургский университет (сейчас Санкт-Петербургский государственный университет) на историко-филологический факультет.
1828 г. – в числе шести лучших студентов направлен в Императорский Дерптский университет (сейчас Тартуский университет, Эстония), где получил степень магистра философии (1832).
1833–1834 гг. – продолжил обучение в Европе: слушал лекции в Париже, Гейдельберге, Мюнхене и Берлине.
1835 г. – вернулся в Россию. Назначен преподавателем кафедры всеобщей истории Императорского Санкт-Петербургского университета и более 30 лет там преподавал (1835–1869). Начал реформирование всей системы преподавания на кафедре, что привело к постепенному становлению первой русской школы исследователей античности. Через год получил чин коллежского асессора (гражданский чин VIII класса) и стал цензором.
1838 г. – блестяще защитил докторскую диссертацию, произведен в экстраординарного профессора.
1844 г. – ординарный профессор, почетный член Петербургского университета, член-корреспондент Академии наук.
Одновременно преподавал историю и статистику во 2-м Кадетском корпусе.
1869–1874 гг. – заведующий кафедрой всеобщей истории Императорского Московского университета (сейчас Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова).
Последние годы жил в своей усадьбе Борки Мстиславского уезда Могилевской губернии (сейчас Мстиславский район Могилевская область), где вместе с братом C.С. Куторга вел культурно-просветительскую работу среди населения Мстиславля и окрестностей.
7 июня 1886 г. М.С. Куторга умер, похоронен в усадьбе Борки.

Источник: Нікалаеў, М. Вышэйшыя школы: сталічны універсітэт : у змесце пра гісторыка Міхаіла Сямёнавіча Кутаргу / Мікола Нікалаеў // Нікалаеў, М. Беларускі Пецярбург / Мікола Нікалаеў. – Санкт-Пецярбург, 2009. – С. 156, 181–182.

Первый в России ученый, который самостоятельно разработал концепцию всемирной истории. Основоположник Петербургской исторической школы.
Главные работы ученого: «Политический строй германцев к 6 веку» (1837), «История Афинской республики» (1848), «Персидские войны» (1858) и др. Автор книги «О науке и ее значении в государстве» (Москва, 1873).
Важнейшая заслуга М.С. Куторги в том, что он тщательно разрабатывал узловые проблемы социальной и политической истории античности – Древней Греции, где зародилась история как наука. Был основоположником университетского антиковедения в Петербурге и Москве.

• 18 ліпеня – 200 год з дня нараджэння М. С. Кутаргі (1809–1886), расійскага і беларускага вучонага–гісторыка, педагога // Новыя кнігі. – 2009. – № 5. – С. 6–7. – (Дадатак «Даты беларускага календара»).
• Алпатаў, М. Ні аковаў, ні абмежаванняў : Куторга Міхаіл Сямёнавіч / М. Алпатаў // Памяць. Чэрыкаўскі раён : гісторыка-дакументальныя хроніка гарадоў і раёнаў Беларусі / рэдактары: Г. П. Берліна [і інш.]. – Мінск, 1994. – С. 152–155.
• Афанасьеў, В. «У вас ёсць Кутарга…» / Вячаслаў Афанасьеў // Краязнаўчая газета. – 2014. – № 30 (жнівень). – С. 6.
• Афанасьеў, В. Гісторык антычнасці : Міхаіл Сямёнавіч Кутарга / Вячаслаў Афанасьеў // Літаратура і мастацтва. – 2009. – 14 жніўня. – С. 12.
• Балберов, Е. Через тернии – к звездам… от могилевской школьной скамьи : о выпускниках могилевской мужской гимназии / Евгений Балберов // Четверг. – 2016. – 24 августа. – С. 11 : фото.
• Ермоленко, В. Белорусы – «первоначальники» истории Древней Греции : Куторга Михаил Семенович / Валерий Ермоленко // Гісторыя: праблемы выкладання. – 2006. – № 12. – С. 46 – 47.
• Звязаў іх лёс з Мсціслаўшчынай : Куторга Міхаіл Сямёнавіч // Памяць : Мсціслаўскі раён : гісторыка-дакументальныя хроніка гарадоў і раёнаў Беларусі / галоўны рэдактра У. І. Лемяшонак. – Мінск, 1999. – С. 80.
• Корнилович, Э. А. Куторга Михаил Семенович (18.07.1809–07.06.1886) / Э. А. Корнилович // Корнилович, Э. А. Беларусь: созвездие политических имен : историко-биографический справочник / Э. А. Корнилович. – Минск, 2009. – С. 21 : фото.
• Корнилович, Э. Величие не знает смерти : Куторга Михаил Семенович / Эдуард Корнилович // Беларуская думка. – 2006. – № 7. – С. 129–136 : фото.
• Корнилович, Э. Все ли мы знаем о Куторге? / Эдуард Корнилович // Святло Кастрычніка (Мсціслаў). – 2005. – 13 ліпеня. – С. 2.
• Корнилович, Э. Мудрая птица из мстиславского гнезда : Куторга Михаил Семенович / Эдуард Корнилович // СБ. Беларусь сегодня. – 2010. – 2 июня. – С. 18.
• Кутарга Міхаіл Сямёнавіч // Асветнікі зямлі Беларускай : X–пачатак ХХ ст. : энцыклапедычны даведнік / галоўны рэдактар Г. П. Пашкоў. – 2-е выданне. – Мінск, 2006. – С. 249.
• Кутарга Міхаіл Сямёнавіч // Энцыклапедыя гісторыі Беларусі : у 6 т. / галоўны рэдактар Г. П. Пашкоў. – Мінск, 1997. – Т. 4 : Кадэты – Ляшчэня. – С. 318–319.
• Марціновіч, А. У антычнасці – любоў і прызванне : Міхаіл Куторга / Алесь Марціновіч // Марціновіч, А. Элегіі забытых дарог : гістарычныя нарысы, эсэ / Алесь Марціновіч. – Мінск, 2001. – С.185–200.